Ingénieur·e de Recherche en Bioinformatique H/F - 91

- Mission principale:

L'ingénieur·e de recherche contribuera au développement et à la mise en oeuvre d'analyses bio-informatiques avancées appliquées à la transcriptomique en cellule unique et à la transcriptomique spatiale.

La personne recrutée aura pour mission de concevoir, adapter et déployer des outils permettant d'explorer l'hétérogénéité et les interactions cellulaires dans le microenvironnement tumoral humain, avec un accent particulier sur les populations myéloïdes (monocytes, macrophages, cellules dendritiques).

- Activités principales:

· Identifier, adapter et utiliser des outils et pipelines existants pour l'analyse de données de transcriptomique en cellule unique (scRNA-seq) et de transcriptomique spatiale (technologies de type MERSCOPE, Visium, etc.)

· Développer de nouveaux scripts ou modules bioinformatiques pour l'intégration et la visualisation de données multi-omiques

· Participer à la conception et à la mise en oeuvre de stratégies analytiques en collaboration avec les biologistes du laboratoire

· Contribuer à l'annotation, la comparaison et l'interprétation biologique des populations cellulaires identifiées

· Documenter et assurer la reproductibilité des analyses (versioning, documentation, pipeline management)

· Participer à la valorisation des résultats (figures, rapports, contribution à la rédaction d'articles scientifiques)

· Interagir avec les autres bioinformaticiens et ingénieurs de l'Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB) pour partager outils et bonnes pratiques